組織運営委員会：本学会の各種規定の見直しや基準作り、政府のパブコメへの対応、学会の後援等の可否についての検討などを主なミッションとします．
研究委員会：「生命倫理学重要論文集」「生命倫理学関係の文書，宣言，法律，判例集」の作成，医学哲学の遺産の検討やその基礎としての医学史の見直しを行います．
企画委員会：公開講座、医哲Café、臨床ケア哲学・倫理学セミナーなどの企画・実施と他の学会との交流および社会や市民へのアウトリーチ活動を行います．
国際学術交流委員会：英文国際誌の発行、海外で開かれる学術会議等の情報の提供，海外研究者の日本への招聘，国際学術シンポの開催などを行います．
編集委員会：学会誌『医学哲学 医学倫理』の編集を行います．
広報委員会：学会ウェブサイトの更新や学会ニューズレターの作成と学会員への配信、また、学会員が関わる研究会やシンポジウム等の行事に関する情報提供を学会メーリングリストを通じて行います．